De nombreuses personnes dans le monde aspirent à devenir hunter, que ce soit pour la gloire et la fortune ou pour d'autres privilèges. Cependant, il est dit que seule une personne sur des centaines de milliers sont admis à l'examen de hunter.
Le voyage de Gon pour devenir hunter, et pour retrouver son père - qui est connu comme étant le plus grand hunter du monde -, commence. Sur sa route, il rencontrera Kirua, un membre d'une famille d'assassin célèbre, Kurapika, déterminé à devenir un Blacklist Hunter pour capturer les criminels responsables de la mort de sa tribu, et Leorio, qui ambitionne de devenir médecin.